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 分類: 質(zhì)譜檢測

靶向代謝組(untargeted metabolomics)是一種常用廣泛篩選的代謝物的的代謝組學(xué)研究方法,作為表觀的最直接體現(xiàn)者,近年來來一直深受各位學(xué)者的追捧。隨著檢測技術(shù)手段的不斷升級,為了提供更好更高質(zhì)量的代謝組學(xué)數(shù)據(jù),?不斷的加大研發(fā)的力度,提升非靶向代謝組的檢測質(zhì)量,以挖掘到樣本中更多更準代謝物信息,如何在7天內(nèi)快速做完一個非靶向代謝組的項目?

選用超優(yōu)的平臺

首先要選用高分辨Water Q-TOF質(zhì)譜平臺和成熟穩(wěn)定的質(zhì)控體系,提供準確優(yōu)質(zhì)數(shù)據(jù),平臺特點:

  • 雙離子ESI源,專利LockSpray實時在線矯正技術(shù)(高穩(wěn)定性)—數(shù)據(jù)可靠
  • StepWave 技術(shù),保證滿足痕量檢測的要求(高靈敏度)—低豐度物質(zhì)(新物質(zhì),不曾報道的,好發(fā)文章)

超全的數(shù)據(jù)庫

欲善其事必先利其器,數(shù)據(jù)庫是代謝物定性的根本利器,百邁客對本地數(shù)據(jù)庫不斷升級擴大,升級后本地數(shù)據(jù)庫物質(zhì)5000+代謝物,自建庫在行業(yè)中位居前列。

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畫圖工具

文獻里面好看又直觀的的美圖是如何制作出來噠?比如韋恩圖、箱形圖等。這就需要用到一些畫圖工具,這里推薦百邁客云在線分析工具,百邁客云有104款分析小工具,涵蓋基因分析、遺傳進化、ncRNA、質(zhì)控、組裝、比對、數(shù)據(jù)提取、突變、統(tǒng)計、表格處理、繪圖、序列分析等12大功能,非常齊全。

代謝組可以反映生物體表型的狀態(tài)變化。代謝組與轉(zhuǎn)錄組、蛋白組的多組學(xué)聯(lián)合分析可以同時實現(xiàn)從多個層面來探究生物學(xué)問題,相互間進行驗證,從海量的數(shù)據(jù)中篩選出關(guān)鍵基因、蛋白質(zhì)及代謝通路,解釋生物過程的復(fù)雜性和整體性,提高文章的水平。下面為大家推薦幾篇代謝組多組學(xué)聯(lián)合分析的文獻。

案例一

期刊:Journal of Hazardous Materials

IF:14.224

單位:河南科技學(xué)院?河南農(nóng)業(yè)大學(xué)

研究方法:代謝組學(xué)?轉(zhuǎn)錄組學(xué) 蛋白質(zhì)組學(xué)

案例二

期刊:Frontiers in Plant Science

IF:6.627

單位:黑龍江八一龍墾大學(xué)

研究方法:非靶代謝組學(xué)+轉(zhuǎn)錄組學(xué)

案例三

單位:西南大學(xué)

期刊:Environmental and Experimental Botany

IF:6.028

研究策略:轉(zhuǎn)錄組 +代謝組+ICP-MS離子組學(xué)

案例四

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單位:中國科學(xué)院西北生態(tài)環(huán)境資源研究所

期刊:International Journal of Molecular Sciences

IF:4.556

研究策略:微生物組學(xué) +代謝組學(xué)

案例五

單位:四川農(nóng)業(yè)大學(xué)

期刊:Frontiers in Plant Science

IF:6.627

研究策略:轉(zhuǎn)錄組學(xué) +代謝組學(xué)

案例六

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單位:甘肅農(nóng)業(yè)大學(xué)

期刊:Frontiers in Microbiology

IF:6.064

研究策略:轉(zhuǎn)錄組學(xué) +代謝組學(xué)+微生物組學(xué)

案例七

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單位:石河子大學(xué)

期刊:Frontiers in Plant Science

IF:6.627

研究策略:轉(zhuǎn)錄組學(xué) +代謝組學(xué)+微生物組學(xué)

案例八

單位:新鄉(xiāng)醫(yī)學(xué)院

期刊:Science of the Total Environment

IF:10.753

研究策略:微生物多樣性+代謝組

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百邁客生物代謝組項目優(yōu)勢

超廣項目經(jīng)驗

百邁客近一年已完成非靶代謝組項目經(jīng)驗2w+,為使老師更直觀的認知百邁客非靶向代謝組產(chǎn)品,我們對2022年300多個項目數(shù)據(jù)進行了統(tǒng)計,包含物種信息、樣本類型及檢出通量。

  • 超全樣本類型

物種類型涵蓋豐富,包括動物,植物,微生物,細胞類型樣本,小編整理一下近半年的部分樣本類型展示如下表。

樣本 物種 樣本 ? 樣本 物種
植物 法國梧桐 動物 虹鱒 微生物 阿薩希絲孢酵母
三色堇 小鼠 凝結(jié)芽孢桿菌
綿羊 土壤
茶樹 兔子 紅曲霉
麥冬 斷奶仔豬 微生物
桑樹 濃香型大曲
野牛草 兔子 酒醅
鐵皮石斛 鴿 梭菌
絹蒿 小鼠 真菌
青稞 黇鹿 芽孢桿菌
紫蘇 大黃魚 酵母菌
杜仲 草地貪夜蛾 鏈霉菌
玉米 麥蛾柔繭蜂(蛹) 其他 細胞
紫花苜蓿 貽貝 …..
青稞(大麥) 小金蝠蛾
菊花

  • 超高檢測通量

小編統(tǒng)計了2022年近兩個月的植物樣本的非靶物質(zhì)檢出情況,植物樣本中二級鑒定到的物質(zhì)數(shù)量最高4700,平均檢出3199個物質(zhì),隨后隨機抽取了20個項目,涉及不同物種,針對植物樣本中二級鑒定到的物質(zhì)數(shù)目,繪制成了以下:

超高檢測穩(wěn)定性

小編對部分植物項目的檢出情況進行了歸納,得到了各個檢出水平的項目占比,具體如下圖:

從圖可以看到植物樣本,85%以上的項目二級檢出物質(zhì)數(shù)均在2000+個以上,65%以上的項目二級檢出物質(zhì)數(shù)均在3000個以上,通過這些項目實測數(shù)據(jù)足以看出,百邁客非靶產(chǎn)品對代謝物鑒定具有強大檢測能力!

?超全物質(zhì)覆蓋度

非靶向代謝組學(xué)技術(shù)無偏向性捕獲代謝物數(shù)據(jù),小編統(tǒng)計了部分項目,主要檢出類別如下表:

Class 分類 Class 分類
Organooxygen compounds 有機氧化合物 Nucleotides and derivatives 核苷酸及其衍生物
Carboxylic acids and derivatives 碳水化合物及其衍生物 Organonitrogen compounds 有機氮及其衍生物
Coumarins and derivatives 香豆素及其衍生物 isflavoids 異黃酮
Benzene and substituted derivatives 苯及其取代衍生物 fatty acids 脂肪酸類
Flavonoids 黃酮類化合物 glycerolipids 甘油脂類
Phenols 酚類化合物 glycerophospholipids 甘油磷脂類
Indoles and derivatives 吲哚及其衍生物 sphingolipids 鞘脂類
Aminno acids and derivatives 氨基酸及其衍生物 prenol lipids 孕烯醇酮脂類
Carboxylic acids and derivatives 羧酸及其衍生物 saccharolipids 糖脂類
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百邁客開學(xué)季活動火熱進行中,開學(xué)鉅惠!

 

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