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 分類: 文獻(xiàn)解讀, 質(zhì)譜檢測(cè)

作物的產(chǎn)量和品質(zhì)一直是農(nóng)業(yè)科研工作者的關(guān)注重點(diǎn),植物代謝物中很多是與人類健康密切相關(guān)的營養(yǎng)成分。近年,植物代謝組學(xué)也開始應(yīng)用于主要農(nóng)作物(如水稻、玉米等)的產(chǎn)量、品質(zhì)性狀等育種研究領(lǐng)域。在育種工作中,尤其是分子設(shè)計(jì)育種中,√確定量描述作物的產(chǎn)量和品質(zhì)性狀是篩選育種材料的關(guān)鍵。利用代謝組學(xué)方法,可以快速的對(duì)作物營養(yǎng)成分進(jìn)行分析,對(duì)其品質(zhì)進(jìn)行評(píng)價(jià)。

基于“非靶向代謝組學(xué)”,實(shí)現(xiàn)了高靈敏度、高通量的代謝物鑒定。 該平臺(tái)可進(jìn)行脂溶、水溶性代謝物的z確定性和√確定量,并結(jié)合多元商業(yè)軟件及自建分析流程搭建了基于代謝組的多組學(xué)數(shù)據(jù)整合分析流程。我們將通過幾篇文獻(xiàn)為大家概述非靶代謝在植物品質(zhì)研究中的應(yīng)用。

案例一

運(yùn)用非靶向代謝組學(xué)和化學(xué)計(jì)量學(xué)鑒定分析苦茶中苦味的關(guān)鍵代謝物

研究對(duì)象:苦茶(5個(gè)茶葉品種KC1,KC2,YH9,TGY,QX1)

研究技術(shù):非靶向代謝組學(xué)、高效液相色譜定量分析

研究路線

研究結(jié)果:采用非靶向代謝組學(xué)方法,研究了苦茶的代謝物。結(jié)果表明,2個(gè)苦茶品種與3個(gè)對(duì)照普通茶品種之間共鑒定出90種差異代謝物。其中,茶苦堿等8種代謝物在KC1和KC2中的含量均顯著高于對(duì)照品種。這些化合物中的大多數(shù)都是導(dǎo)致苦茶苦味的重要因素?;诟咝б合嗌V的定量分析結(jié)果與LC-MS分析結(jié)果相似,表明苦茶中茶苦堿和EGCG含量高于對(duì)照品種。此外,研究數(shù)據(jù)還表明,苦茶的強(qiáng)烈苦味可能是兒茶素、生物堿、黃酮醇和黃酮醇/黃酮苷、氨基酸和酚酸的綜合作用的結(jié)果。為進(jìn)一步研究苦茶的苦味和營養(yǎng)特性提供了理論依據(jù)。


不同茶葉KC1、KC2、YH9、TGY、QX1代謝產(chǎn)物的熱圖

案例二

通過非靶向代謝組學(xué)分析靈芝的發(fā)酵液,菌絲體,子實(shí)體和孢子粉的代謝特征

研究對(duì)象:靈芝的不同部位(發(fā)酵液,菌絲體,子實(shí)體和孢子粉)

研究技術(shù):LC-MS非靶向代謝組學(xué)

研究路線

研究結(jié)果:這項(xiàng)研究運(yùn)用靈芝的不同部分,通過非靶向代謝組學(xué)研究靈芝不同部位的功能和藥效。根據(jù)非靶向代謝組學(xué)的結(jié)果,得出子實(shí)體可以特別用作抗腫瘤和抗艾滋病藥物;孢子粉可用于開發(fā)治療肝病和糖尿病的藥物;靈芝的四個(gè)部分可用于抗氧化劑領(lǐng)域。本研究為靈芝的質(zhì)量評(píng)價(jià)和綜合利用提供了理論依據(jù)。


靈芝不同部分生物堿類化合物熱圖

靈芝不同部分多糖和核苷類化合物熱圖

案例三

利用野生番茄漸滲系闡明轉(zhuǎn)錄組和代謝組變異對(duì)果實(shí)性狀和病原菌響應(yīng)的遺傳基礎(chǔ)的潛在影響

研究對(duì)象:番茄的果實(shí)和果皮(504個(gè)BILs和76個(gè)ILs)

研究技術(shù):LC-MS非靶代謝組學(xué)、轉(zhuǎn)錄組學(xué)

研究路線

研究結(jié)果:本研究利用秘魯野生番茄品種(PI246502或LA0716)和現(xiàn)代栽培品種番茄M82構(gòu)建了番茄的作圖群體。通過對(duì)580個(gè)系進(jìn)行非靶代謝組學(xué)和轉(zhuǎn)錄組學(xué)分析,結(jié)合病原體敏感性分析,確定了與數(shù)百個(gè)轉(zhuǎn)錄本和代謝產(chǎn)物水平相關(guān)的基因組位點(diǎn)。另外,本文鑒定了茄堿途徑的組成部分,以及參與病原體防御的基因和代謝物,并將真菌抗性與果實(shí)成熟調(diào)控網(wǎng)絡(luò)的變化聯(lián)系起來。這項(xiàng)研究推測(cè)出的基因型-表型關(guān)聯(lián)將對(duì)目前的分子育種做出重大貢獻(xiàn),有助于對(duì)抗風(fēng)味和抗病性等關(guān)鍵水果質(zhì)量性狀的丟失,并為研究關(guān)鍵果實(shí)品質(zhì)性狀提供了依據(jù)。

野生番茄物種滲入的多模態(tài)研究

總結(jié)

目前的研究大多集中在模式植物中,對(duì)非模式植物,特別是重要藥用植物的研究較為薄弱。以植物代謝組學(xué)為切入點(diǎn),繪制植物代謝網(wǎng)絡(luò),將生物事件與代謝表型關(guān)聯(lián)起來,從而闡明其中的作用機(jī)制和效應(yīng)物質(zhì)基礎(chǔ),再與其他系統(tǒng)生物學(xué)組學(xué)聯(lián)合分析,勢(shì)必會(huì)將植物研究提升到另一個(gè)高度和深度。

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