CircRNA是真核生物中共價封閉的內(nèi)源性生物分子，具有組織特異性和細胞特異性的表達特點。其來源方式多樣，不易受RNA外切酶影響,表達更穩(wěn)定,不易降解，許多circRNA可通過充當(dāng)microRNA的“海綿”或某些蛋白質(zhì)的抑制劑，從而阻斷miRNA對靶基因的抑制作用，同時調(diào)控其他類型RNA的表達，circRNA一直是科研人員關(guān)注的熱點研究之一，并且隨著CircRNA的編碼能力的發(fā)現(xiàn)，circRNA的研究更是吸引了大家的目光。
近期，Nature發(fā)表了一篇關(guān)于真核生物中的CircRNA研究發(fā)展的評論（Widespread occurrence of circular RNA in eukaryotes），文章中介紹了從在20世紀70年代末到當(dāng)前CircRNA的主要發(fā)展節(jié)點，從80年代，CircRNAs被認為起源于RNAs的副產(chǎn)物，到2013年，《自然》雜志同一期的兩篇文章報道了真核生物中數(shù)千個含有外顯子序列的CircRNAs，再到Memczak和Rajewsky等人的論文揭示了CircRNA參與的復(fù)雜調(diào)控網(wǎng)絡(luò)，CircRNA的研究一直在如火如荼的進行中。據(jù)不完全統(tǒng)計，僅2020年已發(fā)表的circRNA相關(guān)文章，影響因子大于10的文章有99篇，5~10的文章有324篇，小于5的文章1468篇！特別是影響因子>10的CircRNA文章數(shù)量相比之前的五年有明顯增長。
百邁客生物作為國內(nèi)轉(zhuǎn)錄組學(xué)研究的先行者，不僅對于線性RNA的研究經(jīng)驗豐富，在非編碼RNA的研究方向上也身經(jīng)百戰(zhàn)，涉及覆蓋動物、植物、真菌等近百個物種類型，為了方便客戶的數(shù)據(jù)挖掘，同時也配備了專業(yè)完善的分析平臺，今天就要向各位宣布一個好消息，CircRNA的個性化上線啦！
一、基因查找不費勁
CircRNA的功能分析主要依靠于來源基因的功能注釋，如何在海量的數(shù)據(jù)中直接找到關(guān)心的目的基因呢?首先就是根據(jù)功能注釋進行檢索，百邁客云平臺的CircRNA分析平臺中，支持針對結(jié)果根據(jù)八大功能數(shù)據(jù)庫的注釋信息批量檢索相關(guān)注釋基因、并且批量提取相關(guān)信息；靶向關(guān)系的預(yù)測也是關(guān)鍵circRNA檢索的必要一步，CircRNA分析平臺同時支持通過miRNA的ID批量提取相關(guān)靶向的CircRNA信息，此外，CircRNA ID、來源基因ID、來源基因name等功能，通過上傳ID文件均可實現(xiàn)批量查詢，甚至可以批量下載序列文件，省去多個文件來回切換的繁雜操作，一鍵式提取關(guān)鍵信息！
二、功能注釋富集分析信手拈來
CircRNA的調(diào)控作用深度挖掘離不開功能富集分析，研究角度的多樣、篩選條件的調(diào)整直接導(dǎo)致圖形繪制的重復(fù)工作量，為了讓老師們不再為美觀多樣的富集圖繪制而感到頭禿，CircRNA云平臺支持多種富集圖在線繪制，無需整理復(fù)雜多樣的輸入文件，無需學(xué)習(xí)晦澀難懂的生信語言，無論怎么調(diào)整基因集合，只需要一個點擊，美觀準確的八大類型富集圖即刻獲得！（配合基因篩選功能使用更佳哦~）
三、差異參數(shù)任性調(diào)整
對于需要通過結(jié)果分析挑選關(guān)鍵基因的研究方向來說，選擇合適的差異篩選條件對于基因的選擇是事半功倍的，但是往往合適的篩選條件需要多次的調(diào)整摸索，這時差異篩選條件的調(diào)整功能顯得尤為重要，CircRNA云平臺同樣支持在線完成差異參數(shù)的調(diào)整，基因數(shù)目太少、差異軟件不合適、參數(shù)設(shè)置不合理等問題，通通可以調(diào)整！不限次、不限時，只需簡單的點擊，輕松完成！
四、多個分組輕松比較
單一變量下的差異比較組結(jié)果往往無法證明相應(yīng)結(jié)論，所以往往會設(shè)置多個比較組，當(dāng)有多個差異比較組時，如何輕松篩選在各個集合間不同表達模式的基因顯得尤為重要，此時，韋恩圖扮演了重要的角色，通過不同比較組基因集合的韋恩圖，我們可以輕松獲得在任意比較組中特意表達或者在各個組合中共同表達的基因集合，CircRNA分析平臺分別配有基因表達韋恩圖（篩選不同樣本中特有或者共有表達基因集）以及差異表達韋恩圖（篩選不同差異分組中特有或者共有表達基因集），進一步配合上下調(diào)基因的篩選，輕松找出有連續(xù)變化模式的基因集（這些基因可能是性狀相關(guān)的關(guān)鍵基因哦~
五、共表達分析助力數(shù)據(jù)挖掘
共表達分析常用于識別差異表達基因的共表達模式，分析各樣品間CircRNA表達豐度的不同變化模式，將相同表達趨勢的CircRNA劃分為一個數(shù)據(jù)集，通常我們認為，具有相同表達變化趨勢的基因的功能互有關(guān)聯(lián)，所以通過分析CircRNA的共表達趨勢分析，可以進一步篩選出項目中關(guān)鍵的基因集合。CircRNA分析平臺搭載了共表達分析個性化，簡單的選擇基因集合以及樣本即可完成分析。
百邁客云平臺搭載的個性化功能，無需整理復(fù)雜的輸入文件、無需掌握晦澀的生信語言、不受時間空間的限制，只要有互聯(lián)網(wǎng)的地方，全年365天，全天24小時均能開展數(shù)據(jù)挖掘，任何您靈感迸發(fā)的瞬間，都可以登陸平臺完成分析！目前轉(zhuǎn)錄調(diào)控全線全產(chǎn)品均已上云，完善的云服務(wù)模式深度助力提升客戶體驗，更多好用的功能期待您的體驗！
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