百邁客已有十年科技服務(wù)經(jīng)驗(yàn),在十年的成長道路上,為越來越多的轉(zhuǎn)錄組測序項(xiàng)目提供驗(yàn)證實(shí)驗(yàn)服務(wù),轉(zhuǎn)錄組+qPCR定量驗(yàn)證已成為科學(xué)研究的常見技術(shù)。
百邁客秉承“持續(xù)創(chuàng)新、追求卓越、客戶至上、拼搏奮進(jìn)、團(tuán)結(jié)協(xié)作”的核心價(jià)值觀,十年科研服務(wù)經(jīng)驗(yàn),致力于打通基因測序與結(jié)果驗(yàn)證,給客戶提供更全面的科研服務(wù)?;谑昕品?jīng)驗(yàn)和qPCR技術(shù)團(tuán)隊(duì)實(shí)驗(yàn)經(jīng)驗(yàn),正式推出試劑盒產(chǎn)品Biomarker 2X SYBR Green Fast qPCR Mix,用于高通量測序結(jié)果的基因驗(yàn)證。
新品上市,怎么能沒有活動(dòng)呢?接好啦~~
活動(dòng)內(nèi)容
轉(zhuǎn)錄組滿12個(gè)樣品,免費(fèi)贈(zèng)送qPCR試劑盒,高達(dá)500次反應(yīng)/盒。
活動(dòng)時(shí)間:2020年3月份
活動(dòng)要求:
1、三月份完成簽單和送樣;
2、贈(zèng)送試劑盒待項(xiàng)目結(jié)題后,由所在地區(qū)區(qū)域經(jīng)理負(fù)責(zé)配送;
3、文章發(fā)表時(shí),需注明轉(zhuǎn)錄組測序分析及qPCR試劑盒由百邁客提供,見刊后提供全文。
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案例分享
英文題目:Global transcriptomic analysis of zebrafish in response to embryonic exposure to three antidepressants, amitriptyline, fluoxetine and mianserin
中文題目:轉(zhuǎn)錄組分析斑馬魚胚胎暴露于三種抗抑郁藥(阿米替林,氟西汀和米安色林)的應(yīng)答機(jī)理
發(fā)表雜志:Aquatic Toxicology
影響因子:4.129
合作單位:上海大學(xué)環(huán)境與化學(xué)工程學(xué)院
研究背景
人用和獸用藥物是一種新興的有機(jī)污染物,首次發(fā)現(xiàn)是在20世紀(jì)70年代的時(shí)候,在污水流出物中檢測出。藥物的生產(chǎn)和發(fā)展旨在治愈疾病、改善人類健康,但由于過量或過期藥物的隨意排放,同時(shí)廢水處理廠(WWTPs)對大多數(shù)藥物殘留的去除較為低效,所以低濃度藥物及其分解產(chǎn)物仍然廣泛分布在水生系統(tǒng)中。
抗抑郁藥是全球治療焦慮、恐慌癥和抑郁癥最常用的藥物。它們也是水生環(huán)境中最常檢測到的藥物。已有研究表明,多種抗抑郁藥物在水生環(huán)境及水生生物中積累,抗抑郁藥物可能會(huì)影響水生生物的繁殖能力、生存、生長、捕食和學(xué)習(xí)行為,但是抗抑郁藥物影響水生生物的作用機(jī)制仍然難以明確。
作者為了更好地了解不同種類抗抑郁藥誘導(dǎo)的毒性反應(yīng)在非靶向魚類中的作用機(jī)制,用分屬于不同抗抑郁藥物類別的阿米替林(Amitriptyline hydrochloride)、氟西?。‵luoxetine hydrochloride)和鹽酸米安色林(mianserin hydrochloride)對早期發(fā)育階段的斑馬魚胚胎進(jìn)行處理,然后進(jìn)行了轉(zhuǎn)錄組測序(RNA-Seq),基于前面轉(zhuǎn)錄組的分析結(jié)果,作者采取兩組qPCR驗(yàn)證實(shí)驗(yàn):
1.?DEG表達(dá)模式驗(yàn)證
作者根據(jù)RNA- seq結(jié)果選取了15個(gè)基因(4個(gè)上調(diào)、11個(gè)下調(diào)),用qPCR驗(yàn)證其表達(dá)模式。結(jié)果表明,qPCR結(jié)果與RNA-Seq結(jié)果相似(圖3A~C)。此外,通過線性擬合和皮爾遜相關(guān)性方法分析了RNA-Seq和qPCR的結(jié)果間的相關(guān)性,結(jié)果表明兩種方法的分析結(jié)果呈顯著正相關(guān)(圖3D~F)。
2.不同濃度的抗抑郁藥物處理下DEG的應(yīng)答反應(yīng)
作者用三種不同濃度的抗抑郁藥(0.1、1和10 μg /L)處理斑馬魚胚胎,應(yīng)用qPCR試驗(yàn)確定6個(gè)選定的基因的濃度—應(yīng)答關(guān)系。結(jié)果表明,ptgdsb的mRNA水平只在1 μg /L阿米替林和10 μg /L米安色林處理組顯著降低;而dusp5表達(dá)水平在10 μg /L阿米替林和米安色林處理組以及所有氟西汀處理組中均顯著降低;除了在1和10 μg /L阿米替林處理組中的nr1d1表達(dá)水平未受抑制之外,nr1d1和per2在幾乎所有抗抑郁藥物處理組均受到顯著抑制。此外,兩個(gè)與早期生長應(yīng)答相關(guān)的基因egr1和egr4在0.1和10 μg /L阿米替林處理組和所有米安色林處理組中表達(dá)下調(diào),egr4在所有氟西汀處理組降低,而egr1只在0.1和10 μg /L氟西汀處理組中表達(dá)降低(圖4)。
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