前沿 | NEW ENGL J MED（IF=79.258）宏基因組測序輔助腦膜炎和腦炎臨床診斷

【出發(fā)點】

腦脊液（CSF）的宏基因組測序（NGS）具有在單次測試中鑒定多種病原體的潛力。

【方法】

在一項為期1年的多中心前瞻性研究中，作者團隊研究了CSF的宏基因組測序在住院患者中診斷傳染性腦膜炎和腦炎的有效性。通過正交實驗室測試證實了對宏基因組測序后病原體的所有陽性測試。通過與臨床微生物測序委員會的電話會議和調(diào)查引發(fā)醫(yī)師反饋。通過回顧性圖表評估評估臨床效果。

【結(jié)果】

作者團隊在8家醫(yī)院招募了204名兒科和成人患者?；颊卟∏閲乐兀?8.5％的患者入住重癥監(jiān)護室，所有研究患者中30天死亡率為11.3％。 57名患者（27.9％）共診斷出58種神經(jīng)系統(tǒng)感染。在這58種感染中，宏基因組測序結(jié)果發(fā)現(xiàn)13種（22％）未在源醫(yī)院通過臨床試驗確定。在剩余的45種感染（78％）中，19種在傳統(tǒng)檢測和宏基因組測序結(jié)果中同時進行了診斷。在未通過宏基因組鑒定的26種感染中，11種僅通過血清學檢測確診，7種通過CSF以外的組織樣本診斷，8種由于CSF中的病原體滴度低為陰性。僅由宏基因組測序結(jié)果診斷13種中，8個可能具有臨床效果，13種中7個用于指導治療。

【結(jié)論】

常規(guī)微生物檢測通常不足以檢測所有神經(jīng)侵襲性病原體。在這項研究中，從腦膜炎或腦炎患者獲得的腦脊液的宏基因組測序改善了神經(jīng)系統(tǒng)感染的診斷，并在某些情況下提供了可操作的信息。