產(chǎn)品介紹
????????全長轉(zhuǎn)錄組測序是利用PacBio平臺對某一物種的mRNA進行測序研究,因其可直接獲得從5’端到3’端的高質(zhì)量轉(zhuǎn)錄組信息而稱為全長轉(zhuǎn)錄組測序。全長轉(zhuǎn)錄組測序無需組裝,直接獲得單分子全長mRNA信息,同時可準確鑒定基因的可變剪接、APA、融合基因、基因家族和非編碼RNA等信息,全長轉(zhuǎn)錄組成為近年來的一大研究熱點。
全長轉(zhuǎn)錄組百邁客優(yōu)勢
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分析流程再升級,項目周期更短
百邁客全長轉(zhuǎn)錄組項目建庫測序和信息分析全面升級,經(jīng)各個環(huán)節(jié)嚴格把控:
純?nèi)L轉(zhuǎn)錄組僅需30個工作日!
2+3全長轉(zhuǎn)錄組項目僅需40個工作日!
兩個月極速完成二代和三代聯(lián)合分析,對于想快速發(fā)文章的科研工作者,采用三代新技術(shù)研究生物學問題無疑是很好的選擇。
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分析內(nèi)容更專業(yè)、更全面
百邁客全長轉(zhuǎn)錄組新增分析內(nèi)容:
(1)轉(zhuǎn)錄因子預(yù)測
????????轉(zhuǎn)錄因子也稱反式作用因子,在動植物的生長發(fā)育及其對外界環(huán)境的反應(yīng)中起著重要的調(diào)控作用,通過轉(zhuǎn)錄因子注釋或表達量聚類分析,挖掘調(diào)控生物表型的關(guān)鍵轉(zhuǎn)錄因子。
(2)可變剪接結(jié)果可視化交付
????????可變剪接在產(chǎn)生轉(zhuǎn)錄本多樣性、控制調(diào)節(jié)生長發(fā)育等方面起決定性作用,可變剪接可視化能夠?qū)ν怙@子結(jié)構(gòu)進行展示,有助于更直觀分析轉(zhuǎn)錄本可變剪切事件。
(3)差異可變剪接分析
????????通過rMATS軟件分析獲得獲得不同分組之間的差異可變剪接事件。
(4)Circos圖
????????通過Circos圖可以直觀比較基因組和三代測序結(jié)果中基因密度、轉(zhuǎn)錄本密度,以及l(fā)ncRNA和融合轉(zhuǎn)錄本在染色體分布。
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數(shù)據(jù)產(chǎn)出創(chuàng)新高、質(zhì)量更好
????????采用官方發(fā)布升級的Sequel2.1試劑,近期百邁客三代測序研發(fā)人員經(jīng)大量實驗條件摸索,數(shù)據(jù)產(chǎn)出又創(chuàng)新高,由11-12G/Cell提升到了18-20G/Cell的平均水平。同時,平均酶讀長也達到了30K以上。酶讀長的有效增加,有利于拿到更多的高質(zhì)量全長轉(zhuǎn)錄數(shù)據(jù),從而有效提高全長轉(zhuǎn)錄組的分析質(zhì)量。
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項目經(jīng)驗豐富,國內(nèi)合作成功案例更多
????????自2015百邁客從事全長轉(zhuǎn)錄組的科學研究服務(wù),為廣大科研工作者提供了新的研究視角。截止2018年7月,百邁客全長轉(zhuǎn)錄組已發(fā)表文獻共6篇,研究的物種分別有楊樹、甘薯、野生甘薯、兔子、跳甲和辣椒,覆蓋領(lǐng)域分別為林木、哺乳動物、昆蟲和作物等。
????????百邁客全長轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)產(chǎn)出更高、周期更快、分析更全面,為回饋廣大科研者對百邁客的支持,百邁客特推出全長轉(zhuǎn)錄組贈送優(yōu)惠活動:
優(yōu)惠一:加量不加價
提高測序數(shù)據(jù)量可以覆蓋更多低豐度,低表達轉(zhuǎn)錄本,從而獲得更全面的轉(zhuǎn)錄本信息。
15Gb全長轉(zhuǎn)錄組現(xiàn)價29999,免費贈送3Gb,數(shù)據(jù)量提升至18Gb;
30bG全長轉(zhuǎn)錄組現(xiàn)價55000,免費贈送5Gb,數(shù)據(jù)量提升至35Gb;
優(yōu)惠二:2+3全長轉(zhuǎn)錄組聯(lián)合分析
全長轉(zhuǎn)錄組可以準確分析轉(zhuǎn)錄本結(jié)構(gòu),二代數(shù)據(jù)利用其優(yōu)勢,可以對轉(zhuǎn)錄組本定量,從而實現(xiàn)對轉(zhuǎn)錄本定性和定量研究。
2018年9月30日之前簽訂合同并送樣品,即可享受二代測序1200/樣。
優(yōu)惠三:免費贈送全長轉(zhuǎn)錄組線上培訓班名額
百邁客不定期推出線上全長轉(zhuǎn)錄組培訓班,詳細解讀分析結(jié)果和數(shù)據(jù)挖掘,助您快速實現(xiàn)文章的轉(zhuǎn)化。
活動期間簽訂全長轉(zhuǎn)錄組合同,即免費贈送百邁客全長轉(zhuǎn)錄組線上培訓班名額一個,部分課程如下:
課程名稱 | 內(nèi)容介紹 |
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全長轉(zhuǎn)錄組實驗原理及測序方案選擇 | 實驗原理、測序策略(文庫、數(shù)據(jù)量) |
基因結(jié)構(gòu)/基因功能研究方案設(shè)計及文章架構(gòu)解析 | 數(shù)據(jù)挖掘角度、圖表解析、文章寫作思路 |
全長轉(zhuǎn)錄組與蛋白組/基因組聯(lián)合研究 | 數(shù)據(jù)挖掘角度、圖表解析、文章寫作思路 |
全長轉(zhuǎn)錄組結(jié)題報告解讀:有參、無參 | 分析流程、軟件原理、參數(shù)選擇、分析結(jié)果解讀 |
活動時間:8月1日—9月30日