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 分類: 醫(yī)學(xué)研究

核酸(nucleic acid)在生物界中堪稱主宰,是一類非常重要的生物大分子,它在生物的繁衍、發(fā)育、維持、衰老和死亡等一切生命活動中扮演著重要的角色,如果其結(jié)構(gòu)出現(xiàn)稍許的變動,比如一個堿基的差錯、缺失或增加,就有可能導(dǎo)致突變、缺陷或疾病的出現(xiàn),所以核酸已成為生物化學(xué)、遺傳學(xué)以及其他有關(guān)生命學(xué)科的熱門研究課題,其覆蓋面之廣、進展之速為其他學(xué)科所望塵莫及。而進行核酸研究的第一個前提就是能夠?qū)⒑怂釓谋姸嗉姺睆?fù)雜的生物大分子中提取出來,并純化到一定程度,以便進行相應(yīng)的科學(xué)研究和實際應(yīng)用。
核酸,快到“管”里來共分六期,通過此系列與大家分享核酸提取樣品制備、提取方法及檢測方面的知識,以期能夠?qū)Υ蠹业目蒲杏兴鶐椭?/p>

1.全血樣品

01.采血管選擇
采集血液進行檢測面臨的一個主要問題就是細胞內(nèi)RNA的不穩(wěn)定性,RNA在采血后數(shù)小時內(nèi)便會迅速降解。此外,某些種屬的RNA在采血后會通過基因誘導(dǎo)在體外增加。體外RNA降解和基因誘導(dǎo)均可導(dǎo)致體內(nèi)相關(guān)基因的轉(zhuǎn)錄本數(shù)目低估或高估。
BD公司的PAXgene血液RNA管內(nèi)含能夠穩(wěn)定體內(nèi)基因轉(zhuǎn)錄性狀的添加劑,它能夠減少體外RNA的降解,并將基因誘導(dǎo)的水平降低到最小程度,適用于人和靈長類動物全血樣品制備,對于全血樣品,我們只推薦使用此管送樣。

BD PAXgene血液RNA管(貨號762165)

02.采集血液
使用PAXgene血液RNA管前請仔細閱讀產(chǎn)品說明書,以便進行正確的操作。如果PAXgene血液RNA管為唯一的抽血管,則將血液抽入PAXgene血液RNA管之前應(yīng)先抽血入“廢棄管”內(nèi),使抽血過程中所用的采血器內(nèi)能被血液預(yù)灌注;否則PAXgene血液RNA管應(yīng)為抽血程序中的最后一只試管。確保血液已停止流入試管再從持針器上取下試管(PAXgene血液RNA管內(nèi)的負壓設(shè)計可向管內(nèi)抽2.5ml的血)。

采血后應(yīng)立即將PAXgene血液RNA管輕輕地顛倒8-10次,以確保管內(nèi)保護劑和血液充分混合均勻。

03.保存、運輸
將PAXgene血液RNA管豎直置于室溫(18-25℃)靜置2-24小時,之后可貯藏于-20℃或更低溫度;若試管要貯藏于低于-20℃的溫度,先在-20℃冷凍24小時,然后再將其轉(zhuǎn)移到-70℃或-80℃,可保存至少50個月。大體積干冰運輸。

2.血清血漿樣品

由于細胞內(nèi)含有的RNA的豐度遠高于血液中游離的RNA,即使極少量細胞的存在也會對血液中游離RNA的分析造成很大影響。故去除細胞和細胞碎片的污染是血清血漿樣品制備過程的關(guān)鍵。

01.采血管選擇
對于血清樣品,使用普通血清真空采血管即可;對于血漿樣品,推薦使用EDTA抗凝管,禁止使用肝素類抗凝管。

02.血漿樣品的分離、保存
使用EDTA抗凝管采集血液樣品(采集后的血液樣品可置于室溫或4℃短暫保存,但不得超過1h)。1900g(或3000rpm),4℃,離心10min。小心轉(zhuǎn)移上層血漿(黃色)至新的1.5ml離心管中,槍頭不要觸碰中間層(白細胞和血小板層)。一般情況下,10ml的血液可分離出4-5ml血漿。將分離出的血漿16000g,4℃,離心10min。槍頭不要觸碰到管底一側(cè)的雜質(zhì),小心轉(zhuǎn)移上清到一個新的1.5ml離心管中,-80℃保存。大體積干冰運輸。

血漿樣品分離

03.血清樣品的分離、保存
使用含凝血激活劑的采血管或普通真空采血管采集血液樣品,室溫靜置10-60min使血液凝集。1900g(或3000rpm),4℃,離心10min。小心轉(zhuǎn)移上層血清(黃色)至新的1.5ml離心管中,槍頭不要觸碰中間層(白細胞和血小板層)。一般情況下,10ml的血液可分離出3-5ml血清。將分離出的血清16000g,4℃,離心10min。槍頭不要觸碰到管底一側(cè)的雜質(zhì),小心轉(zhuǎn)移上清到一個新的1.5ml離心管中,-80℃保存。大體積干冰運輸。

血清樣品分離

3.細胞上清

使用合適的容器收集細胞培養(yǎng)液或其他生物液體。3000g,4℃,離心15min。小心轉(zhuǎn)移上清液至新的無菌離心管中。將分離出的細胞上清液16000g,4℃,離心10min。槍頭不要觸碰到管底一側(cè)的雜質(zhì),小心轉(zhuǎn)移上清到新的無菌離心管中,-80℃保存。大體積干冰運輸。

細胞上清分離

4.外泌體樣品

對于老師自己富集好的外泌體,需要將外泌體溶解在不大于100ul RNase-free的PBS中并充分混勻,以方便后面提取。外泌體樣品溶液置于-80℃保存。大體積干冰運輸。

5.組織樣

用于提取RNA的醫(yī)口組織樣,如果樣品量較小,建議優(yōu)先選擇保護液(RNAlater等)送樣方式。

方案一、保護液送樣(RNAlater等)
用解剖刀將新鮮組織切成長寬高均≤0.5 cm的樣本,小器官如鼠肝、腎和脾可以完整的保存在RNAlater中。將組織樣本浸入5-10倍體積的 RNAlater中,以使組織完全浸沒。將樣本置于4℃孵育過夜(以使 RNAlater 完全滲透組織),然后轉(zhuǎn)移至-80 ℃長期保存。大體積干冰運輸。

方案二、液氮速凍送樣
取下新鮮組織,立即剔除結(jié)締組織和脂肪組織等非研究所需的組織類型,如果組織體積較大,應(yīng)盡量將組織切成長寬高均≤0.5 cm 的小塊(即黃豆大?。Q杆儆妙A(yù)冷的PBS溶液(RNase free)或生理鹽水將組織表面的殘留血液沖洗干凈。將處理好的組織樣本混合均勻后保存于旋蓋的液氮預(yù)冷凍存管中。迅速置于液氮中冷凍約3h,然后轉(zhuǎn)移至-80 ℃長期保存。大體積干冰運輸。

注意事項:
1.對于RNA類項目的癌癥樣品,我們建議手術(shù)取下的組織迅速放入RNAlater中,4℃孵育24小時,然后棄掉RNAlater,切下壞死區(qū)的組織以及癌旁組織,轉(zhuǎn)入旋蓋的液氮預(yù)冷凍存管中,液氮速凍,-80℃保存,干冰運輸。
2.組織樣品離開活體后,建議在3min內(nèi)進行液氮速凍,速凍前操作時間越長,RNA降解的可能性越大。
3.組織樣不建議使用TRIzol送樣,如必須,需充分液氮研磨后溶于適量TRIzol中,組織樣品切勿過量,常溫裂解5min后,-80低溫凍存,干冰運輸。

6.細胞樣品

一次RNA提取反應(yīng)所需細胞數(shù)≤1×10^7個,以3×10^6—1×10^7個為宜。樣品量較大的話,建議按上述要求將細胞樣品分裝至不同的管中。

01.貼壁細胞
從培養(yǎng)箱中取出貼壁培養(yǎng)的細胞,顯微鏡下觀察細胞,確定生長狀態(tài)良好(正常細胞融合度在80 %左右)。棄去培養(yǎng)基,向細胞培養(yǎng)瓶或培養(yǎng)皿中加入5mL PBS(RNase-free,室溫)洗一次。棄盡PBS,加入適量TRIzol,反復(fù)吸打數(shù)次;直至看不見成團的細胞塊,使之充分溶解于裂解液中形成清亮不粘稠的液體。將裂解好的細胞溶液轉(zhuǎn)移至 1.5 mL 旋蓋離心管( RNase-free )中,置于-80 ℃長期保存,大體積干冰運輸。

02.懸浮細胞
首先要確定細胞生長狀態(tài)良好;離心得到細胞沉淀(依據(jù)客戶實驗室細胞離心步驟,注意細胞離心要適度,不要使細胞離心過實而造成裂解液不能充分滲透)。棄去培養(yǎng)基,加入 1 mL PBS(RNase free,室溫),輕輕將細胞沉淀懸起, 轉(zhuǎn)移至2 mL 旋蓋尖底離心管(RNase free)中。離心(依據(jù)客戶實驗室細胞離心步驟,注意細胞離心要適度,不要使細胞離心過實而造成裂解液不能充分滲透)得到細胞沉淀,棄去PBS,加入適量TRIzol中,反復(fù)吸打數(shù)次,直至看不見成團的細胞塊,使之充分溶解于裂解液中。置于-80 ℃長期保存,大體積干冰運輸。

注意事項:
1.如果是DNA項目普通滅菌PBS清洗即可,如果是RNA項目必須是RNAse-free的。
2.獲取細胞不建議用胰蛋白酶處理,胰酶為蛋白,如果有殘留的話會影響后續(xù)實驗。
3.細胞數(shù)量低于5×105建議速凍直接送樣(不用裂解液裂解),由于細胞數(shù)少,我們會安排微量提取。
4.細胞類樣品不建議保存于RNAlater類組織RNA保護液中送樣,因為RNAlater密度大,保存于其中的細胞難于再離心收集用于提取。

本篇完結(jié),有才的小編突發(fā)奇想,愿以本篇軟文的角度賦詩一首,送給有緣的你:

你看,或者不看我
我就在這里
不來不去
你懂,或者不懂我
我就在這里
不悲不喜
我愿意住進你的心里
默然,相助
悄然,歡喜
愿你科研順利

分子實驗中心 畢經(jīng)德 | 文案
吳爽 | 審核
圖片來自網(wǎng)絡(luò),侵刪

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