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近日,百邁客云3.0正式上線,繼續(xù)加速國(guó)內(nèi)生命科學(xué)研究模式新變革。

變革:從線下到線上的基因組學(xué)數(shù)據(jù)分析模式變革

基因組學(xué)研究為21世紀(jì)生命科學(xué)研究領(lǐng)域中非常重要關(guān)鍵的一部分,而隨著近年來(lái)高通量測(cè)序技術(shù)的快速發(fā)展,基因數(shù)據(jù)呈現(xiàn)出指數(shù)增長(zhǎng),以高通量測(cè)序數(shù)據(jù)庫(kù) SRA(NCBI維護(hù))為例,2009年數(shù)據(jù)收錄量為10TB,2011年接近100TB,2014年突破了1PB,2015年接近5PB,2016年有 望突破10PB。依賴于本地服務(wù)器與專業(yè)生信分析人員的傳統(tǒng)數(shù)據(jù)分析模式已經(jīng)難以滿足這一大數(shù)據(jù)背景下的基因組學(xué)研究。面對(duì)基因數(shù)據(jù)的指數(shù)積累,傳統(tǒng)解決 方案是添置更多的本地服務(wù)器,招募更多的生物信息分析人員,而服務(wù)器配置維護(hù)、人員招募成本高昂,且可操作性低;其中部分生物學(xué)實(shí)驗(yàn)室會(huì)選擇依賴于第三方 測(cè)序數(shù)據(jù)分析服務(wù)提供商。依賴于第三方數(shù)據(jù)分析服務(wù)存在分析周期長(zhǎng)、溝通成本高、標(biāo)準(zhǔn)化的分析無(wú)法滿足科研需求等缺點(diǎn),這些已經(jīng)嚴(yán)重制約了基因組學(xué)的順利 開(kāi)展。
百邁客云整合新型的云計(jì)算技術(shù)與6年的生物信息分析經(jīng)驗(yàn)為國(guó)內(nèi)的基因組學(xué)研究者提供了合理高效的解決新型方案。

云計(jì)算的獨(dú)到之處就在于幾乎可以提供無(wú)限廉價(jià)的存儲(chǔ)與計(jì)算能力。借助云計(jì)算技術(shù),基因組學(xué)研究者可以通過(guò)網(wǎng)絡(luò)方便的獲取大量基因數(shù)據(jù)分析所需要的基礎(chǔ)計(jì)算 資源(存儲(chǔ)、計(jì)算等),無(wú)需購(gòu)置昂貴的本地服務(wù)器。百邁客云借助這一技術(shù)輕松滿足了大數(shù)據(jù)背景下基因組學(xué)研究人員對(duì)于基礎(chǔ)計(jì)算資源的巨大需求。

作為國(guó)內(nèi)將云計(jì)算與生物信息融合的先驅(qū)者,百邁客云采用獨(dú)創(chuàng)的云計(jì)算文件系統(tǒng)BMKFS,該文件系統(tǒng)由百邁客研發(fā)人員針對(duì)生物信息分析的特點(diǎn)開(kāi)發(fā),支持本 地的塊存儲(chǔ)和基于云的對(duì)象存儲(chǔ)(例如AWS的S3和阿里云的OSS)。使得用戶可以像使用本地硬盤一樣使用存儲(chǔ),同時(shí)還提供了無(wú)限量存儲(chǔ)空間的擴(kuò)展能力, 大大提高數(shù)據(jù)可用性。此外,文件系統(tǒng)還提供了多用戶資源隔離的機(jī)制,具備多種鑒權(quán)和授權(quán)機(jī)制,確保用戶的數(shù)據(jù)安全。該文件系統(tǒng)與現(xiàn)有的S3FS,S3QL 相比,讀寫性能都有了極大提升。另外,數(shù)據(jù)安全作為數(shù)據(jù)分析過(guò)程中重中之重,百邁客云平臺(tái)采用底層數(shù)據(jù)加密存儲(chǔ),提供了嚴(yán)格的用戶資源隔離,并利用完善的 角色權(quán)限控制對(duì)用戶數(shù)據(jù)進(jìn)行多級(jí)數(shù)據(jù)權(quán)限控制,網(wǎng)站的數(shù)據(jù)傳輸采用SSL加密傳輸協(xié)議,從多個(gè)層面確保用戶敏感的基因數(shù)據(jù)的安全。
作為專門為國(guó)內(nèi)基因組學(xué)研究者打造的生物信息分析云平臺(tái),針對(duì)國(guó)內(nèi)生物信息分析人員相對(duì)稀缺、對(duì)第三方數(shù)據(jù)分析服務(wù)提供商依賴性較大的特點(diǎn),百邁客云提供 了相較于國(guó)內(nèi)外同類型云計(jì)算平臺(tái)更高集成化程度的基因組學(xué)數(shù)據(jù)挖掘平臺(tái),無(wú)需用戶自己整合各類分析軟件搭建分析流程,真正意義上實(shí)現(xiàn)一鍵完成數(shù)據(jù)分析,另 外分析平臺(tái)還提供了獨(dú)創(chuàng)性的個(gè)性化分析數(shù)據(jù)挖掘功能,分析內(nèi)容更加全面,無(wú)需依賴第三方,得到更加符合預(yù)期研究目的的數(shù)據(jù)分析結(jié)果,目前分析平臺(tái)覆蓋了轉(zhuǎn) 錄調(diào)控、微生物多樣性、動(dòng)植物重測(cè)序、人類疾病等多個(gè)組學(xué)研究領(lǐng)域。另外,百邁客云也為用戶提供了更加快速、準(zhǔn)確的公共數(shù)據(jù)檢索與分析功能,讓你的分析更 加有章可循,有據(jù)可參。

百邁客云是一個(gè)集大數(shù)據(jù)挖掘、共享、管理和科研協(xié)作的整合平臺(tái),優(yōu)質(zhì)的基礎(chǔ)資源通過(guò)網(wǎng)絡(luò)隨時(shí)獲取,可視化的操作界面適合無(wú)任何編程基礎(chǔ)以及生物信息分析經(jīng)驗(yàn)的研究者,我們要做的就是讓你只需專注于科研,無(wú)需考慮IT。

百邁客云的出現(xiàn)是對(duì)生命科學(xué)研究模式的變革!

引領(lǐng):從百邁客云測(cè)試版到百邁客云3.0,從早期測(cè)試到功能日趨完美

百邁客云于2014年5月開(kāi)始上線測(cè)試,2015年9月召開(kāi)產(chǎn)品論證會(huì),到會(huì)專家有華中農(nóng)業(yè)大學(xué)信息學(xué)院院長(zhǎng)張紅雨教授,中國(guó)科學(xué)院北京基因組研究所章張 研究員,阿里云批量計(jì)算服務(wù)、高性能計(jì)算產(chǎn)品經(jīng)理、高級(jí)專家叢蘭蘭女士,微軟資深合作伙伴、技術(shù)顧問(wèn)、云計(jì)算家楊永波先生,論證會(huì)上專家們就云平臺(tái)的前期 開(kāi)發(fā)給予了充分的肯定。2015年10月百邁客商業(yè)版百邁客云1.0云正式上線運(yùn)營(yíng),成為了國(guó)內(nèi)較早適用于多個(gè)組學(xué)研究領(lǐng)域的綜合性的商業(yè)化運(yùn)營(yíng)生物云計(jì)算平臺(tái)。

目前百邁客云已經(jīng)積累的數(shù)以千計(jì)的注冊(cè)用戶,已經(jīng)為國(guó)內(nèi)基因組學(xué)研究人員成功解決了數(shù)百項(xiàng)的數(shù)據(jù)分析難題。平臺(tái)開(kāi)發(fā)人員由引進(jìn)于VMware、微軟的資深 云計(jì)算工程師與已處理過(guò)上萬(wàn)個(gè)項(xiàng)目、發(fā)表數(shù)百篇SCI核心期刊文章的生物信息分析團(tuán)隊(duì)組成,采用敏捷軟件開(kāi)發(fā)模式,實(shí)現(xiàn)了系統(tǒng)的快速升級(jí)與功能的快速優(yōu) 化,從測(cè)試版本上線到近日的百邁客云3.0上線,平臺(tái)已經(jīng)完成了數(shù)十次的整體升級(jí)與數(shù)百項(xiàng)的功能優(yōu)化。

百邁客云3.0的上線旨在為用戶提供全面的分析內(nèi)容、友好的用戶界面、流暢的分析體驗(yàn)、簡(jiǎn)單智能的分析操作,期待您的體驗(yàn)與使用。

未來(lái)展望

百邁客云以基因數(shù)據(jù)的在線分析出發(fā),讓更多的用戶通過(guò)百邁客云平臺(tái)將數(shù)據(jù)分析變的簡(jiǎn)單、經(jīng)濟(jì),為生命科學(xué)研究提供強(qiáng)有力的支持。未來(lái)百邁客云希望用戶在使 用云平臺(tái)時(shí)既可以實(shí)現(xiàn)對(duì)數(shù)據(jù)的分析、共享,具有相同領(lǐng)域的用戶可以進(jìn)行交流協(xié)作,也可以針對(duì)具體數(shù)據(jù)的處理進(jìn)行分析工具的開(kāi)發(fā),實(shí)現(xiàn)整個(gè)研究體系的互動(dòng)和 和諧發(fā)展。

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