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 分類: 微生物組測序

什么是“隨機森林”算法分析?

隨機森林算法分析是一種基于決策樹的高效的機器學(xué)習(xí)算法,既可以對微生物樣本進行分類,也可以用于回歸分析,“隨機森林”算法分析具有極好的準確率,能夠處理具有高維特征的輸入樣本,能夠評估各個特征在分類問題上的重要性,在微生物研究中作用顯著,“隨機森林”分析屬于非線性分類器,可以挖掘變量之間復(fù)雜的非線性的相互依賴關(guān)系,通過“隨機森林”算法分析,可以找出能夠區(qū)分兩組樣本間差異的關(guān)鍵成分(OTU或物種)

隨機森林分析圖怎么看

隨機森林分析圖是物種重要性點圖。橫坐標為重要性水平【這里的重要性可以理解為差異顯著性】,圖顯示的是組間/樣品間差異明顯的物種,縱坐標為按照重要性排序后的物種名稱。反映了分類器中對分類效果起主要作用的菌屬,按作用從大到小排列。

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