單細胞測序技術(shù)研究進展概述

2月1日，第四軍醫(yī)大學(xué)西京醫(yī)院的研究團隊在《Cell?Mol?Gastroenterol?Hepatol》（IF=7.076）在線發(fā)表了題為“Notch調(diào)節(jié)的c-kit陽性肝竇內(nèi)皮細胞有助于肝臟分區(qū)和再生”的研究成果。該研究通過建立PHx小鼠模型誘導(dǎo)肝再生，并對肝竇內(nèi)皮細胞（SECs）?進行單細胞?RNA?測序，發(fā)現(xiàn)c-kit+SECs?通過Wnt2促進肝臟分區(qū)和再生，并受?Notch?信號調(diào)節(jié)。（DOI:10.1016/j.jcmgh.2022.01.019）

2月3日，中國科學(xué)院北京基因組研究所的研究團隊在《Genomics?Proteomics?Bioinformatics》（IF=7.051）發(fā)表了題為“單細胞轉(zhuǎn)錄組分析揭示間充質(zhì)干細胞的細胞異質(zhì)性”的研究成果。該研究通過對源自骨髓和沃頓氏膠的間充質(zhì)干細胞（MSC）?進行單細胞?RNA測序，繪制了這五個MSC亞群的發(fā)育軌跡，并確定了兩個在自我更新和免疫調(diào)節(jié)方面具有潛在功能的亞群。（DOI:10.1016/j.gpb.2022.01.005）

2月4日，南京醫(yī)科大學(xué)附屬口腔醫(yī)院的研究團隊在《Front?Immunol》（IF=5.085）發(fā)表了題為“CCR2巨噬細胞促進正畸牙齒運動和牙槽骨重塑”的研究成果。該研究利用單細胞RNA測序研究牙槽骨重塑過程中巨噬細胞的轉(zhuǎn)錄組異質(zhì)性，發(fā)現(xiàn)機械力誘導(dǎo)的由?NF-κB通路介導(dǎo)的Ccr2巨噬細胞簇的功能轉(zhuǎn)變，導(dǎo)致促炎反應(yīng)和骨重塑。（DOI:10.3389/fimmu.2022.835986）

2月4日，上海交通大學(xué)的研究團隊在《New?Phytol》（IF=8.512）發(fā)表了題為“水稻單細胞轉(zhuǎn)錄組圖譜定義了水稻小花和花序分生組織的發(fā)育軌跡”的研究成果。該研究使用單細胞?RNA?測序?qū)λ净ㄐ蜻M行分析，構(gòu)建了涵蓋早期生殖發(fā)育過程中花序到小花轉(zhuǎn)變的基因組規(guī)模的基因表達資源，重建了小花和腋生分生組織的分化軌跡，鑒定了高度異質(zhì)性年輕花序中的離散細胞類型和調(diào)節(jié)因子組，并通過原位雜交和熒光標記線進行驗證。（DOI:10.1111/nph.18008）

2月8日，華中農(nóng)業(yè)大學(xué)的研究團隊在《Neuron》（IF=14.415）發(fā)表了題為“神經(jīng)源性神經(jīng)肽Y微調(diào)脾免疫反應(yīng)”的研究成果。該研究通過單細胞測序發(fā)現(xiàn)敲除大鼠腎上和腹腔神經(jīng)節(jié)（SrG-CG）中的?NPY?基因改變了脾淋巴細胞的增殖和活化，證明了NPY是一種用于神經(jīng)免疫系統(tǒng)串?dāng)_的古老語言，可用于緩解感染期間的炎癥風(fēng)暴和調(diào)節(jié)自身免疫性疾病中的免疫平衡。（DOI:10.1016/j.neuron.2022.01.010）

2月15日，河南大學(xué)的研究團隊在《Plant?Cell》（IF=9.618）發(fā)表了題為“玉米單核轉(zhuǎn)錄組全面描述了控制草氣孔運動和發(fā)育的信號網(wǎng)絡(luò)”的研究成果。該研究開發(fā)了植物單核RNA測序平臺，并用它鑒定玉米表皮中成熟和發(fā)育氣孔的細胞，發(fā)現(xiàn)在氣孔發(fā)育和啞鈴形保衛(wèi)細胞形成中保衛(wèi)細胞和輔助細胞之間存在更復(fù)雜的關(guān)系，證實了已知特征并闡明了氣孔發(fā)育的關(guān)鍵參與者。（DOI:10.1093/plcell/koac047）

2月22日，南京大學(xué)醫(yī)學(xué)院的研究團隊在《Proc?Natl?Acad?Sci?USA》（IF=9.412）發(fā)表了題為“以單細胞分辨率破譯人類薄子宮內(nèi)膜的子宮內(nèi)膜生態(tài)位”的研究成果。該研究利用單細胞RNA測序表征人類子宮內(nèi)膜的細胞類型、它們的通訊以及增殖期正常和薄子宮內(nèi)膜中子宮內(nèi)膜生長的潛在機制，提供了對子宮內(nèi)膜再生和生長治療薄子宮內(nèi)膜的治療策略的見解。（DOI:10.1073/pnas.2115912119）

2月23日，中國科學(xué)院上海生物化學(xué)與細胞生物學(xué)研究所的研究團隊在《Adv?Sci》（IF=15.84）發(fā)表了題為“發(fā)現(xiàn)和應(yīng)用對椎間盤穩(wěn)態(tài)和退化至關(guān)重要的產(chǎn)后髓核祖細胞”的研究成果。該研究對髓核（NP）進行單細胞RNA測序，構(gòu)建了一個新的NP細胞圖譜，確定了具有再生潛力的常駐NP祖細胞，并揭示了椎間盤退變的有希望的診斷和治療靶點。（DOI:10.1002/advs.202104888）

2月24日，烏得勒支大學(xué)、香港中文大學(xué)-四川大學(xué)生殖醫(yī)學(xué)聯(lián)合實驗室的研究團隊在《Nat?Commun》（IF=12.121）發(fā)表了題為“人類腦室下區(qū)祖細胞的單細胞分析將?SFRP1?識別為重新激活祖細胞的目標”的研究成果。該研究分離出來自老年人腦室下區(qū)（SVZ）?的祖細胞進行單細胞RNA測序，據(jù)揭示了老年人SVZ?的祖細胞作為晚期少突膠質(zhì)細胞祖細胞的身份，將Wnt通路拮抗劑SFRP1確定為促進老年人SVZ祖細胞靜止的可能信號。（DOI:10.1038/s41467-022-28626-9）

2月25日，溫州醫(yī)科學(xué)大學(xué)的研究團隊在《Acta?Pharmacol?Sin》（IF=6.150）發(fā)表了題為“抗糖尿病藥物canagliflozin阻礙小鼠骨骼肌再生”的研究成果。研究通過體內(nèi)外實驗發(fā)現(xiàn)卡格列凈會損害固有的肌源性再生，并利用單細胞RNA測序揭示了LARS2通過影響線粒體結(jié)構(gòu)和活性在調(diào)節(jié)成肌細胞分化和肌肉再生中發(fā)揮關(guān)鍵作用。該研究的單細胞RNA測序和分析由百邁客提供。（DOI:10.1038/s41401-022-00878-7）

2月24日，內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學(xué)的研究團隊在《Genomics》（IF=6.205）發(fā)表了題為“單細胞測序揭示了絨山羊毛囊再生中真皮乳頭細胞的新存在形式”的研究成果。該研究對具有明顯毛囊周期性的絨山羊進行scRNA測序，構(gòu)建了真皮乳頭細胞譜系分化軌跡，揭示了參與細胞命運決定的關(guān)鍵基因、信號和功能和毛囊再生的分子景觀。（DOI:10.1016/j.ygeno.2022.110316）

總?結(jié)

在發(fā)育方面，單細胞RNA測序和空間轉(zhuǎn)錄組學(xué)等新興技術(shù)正在為理解協(xié)調(diào)細胞命運決定的結(jié)構(gòu)和組織模式的分子調(diào)控提供新的視角。從2月發(fā)表的文章可以看出，更多物種、更多器官的發(fā)育分化正在被解析。

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參考文獻

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