【革命性新技術(shù)】CUT&Tag——ChIP-seq替代技術(shù)

還在為ChIP實(shí)驗(yàn)步驟多而苦惱？？

還在為ChIP實(shí)驗(yàn)周期長而憂愁？？

還在為實(shí)驗(yàn)重復(fù)性差而不快？？

還在為細(xì)胞量不夠而憂悶？？

新產(chǎn)品上市啦
百邁客新產(chǎn)品 CUT&Tag 上市，

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祝您科研無憂！

CUT&Tag技術(shù)原理

CUT&Tag實(shí)驗(yàn)原理[1]

CUT&Tag（Cleavage Under Targets and Tagmentation）是一種可應(yīng)用于表觀遺傳學(xué)領(lǐng)域的DNA-蛋白質(zhì)互作研究新技術(shù)，主要用于研究轉(zhuǎn)錄因子或組蛋白修飾在全基因組上的結(jié)合或分布位點(diǎn)。

Cut&tag vs ChIP-seq

百邁客實(shí)測數(shù)據(jù)展示

CUT&Tag文庫片段分布圖

H4K20me1實(shí)測圖

經(jīng)典案例解讀

蛋白質(zhì)與DNA互作是基因轉(zhuǎn)錄調(diào)控的關(guān)鍵，也是啟動(dòng)基因轉(zhuǎn)錄的前提。2019年4月29日Henikoff實(shí)驗(yàn)室在Nature Communication上公布了新技術(shù)CUT&Tag，與傳統(tǒng)的ChIP-seq相比，CUT&Tag技術(shù)方法簡便易行、背景信號低、重復(fù)性好、讓細(xì)胞量從10,000個(gè)降到了60個(gè)甚至單個(gè)細(xì)胞。

CUT&Tag、CUT&RUN、ChIP-Seq 實(shí)驗(yàn)結(jié)果對比：

CUT&Tag 具有更好的信噪比和更低的背景

重復(fù)性相關(guān)矩陣：

CUT&Tag的靈敏度最高，實(shí)驗(yàn)可重復(fù)性較好

peak-Calling的對比：

CUT&Tag比CUT&RUN、ChIP-seq或ATAC-seq有更高的信號

CUT&Tag 單細(xì)胞測序流程：

能夠?qū)O少量細(xì)胞（60 個(gè)細(xì)胞）甚至單細(xì)胞進(jìn)行分析

參考文獻(xiàn)

[1] Kaya-Okur HS, et al. CUT&Tag for efficient epigenomic profiling of small samples and single cells. Nature Communication, 2019.