小鼠腎臟單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測(cè)序揭示腎臟疾病的潛在細(xì)胞靶點(diǎn)
一直以來(lái),由于對(duì)負(fù)責(zé)腎臟器官多重穩(wěn)態(tài)功能的細(xì)胞類型分子特征信息認(rèn)識(shí)較少,極大地限制了我們對(duì)腎臟疾病發(fā)病機(jī)制的理解。
近日,Jihwan Park等人發(fā)表在SCIENCE上的文章中,作者用單細(xì)胞RNA測(cè)序鑒定了來(lái)自健康小鼠腎臟的57,979個(gè)細(xì)胞的基因表達(dá)特征,以促進(jìn)填補(bǔ)這方面的知識(shí)空白。
基于基因表達(dá)譜特征,作者推斷,由不同基因突變引起,且表型相同的遺傳性腎臟疾病,起源于相同細(xì)胞的不同分化類型。以往認(rèn)知中,在遠(yuǎn)端小管后段和集合管里含有兩類細(xì)胞,即主細(xì)胞(principal cell types ,PCs)和閏細(xì)胞(intercalated cells ,ICs)。該研究結(jié)果表明,收集管不僅包含PC和IC,而且包含第三種不同的過(guò)渡型細(xì)胞類型(介于PC與IC之間),這可能暗示IC和PC代表一系列過(guò)渡型細(xì)胞類型的兩端,并且這兩種細(xì)胞類型可能經(jīng)歷細(xì)胞轉(zhuǎn)變。計(jì)算細(xì)胞軌跡分析和體內(nèi)譜系追蹤的結(jié)果表明,由Notch信號(hào)傳導(dǎo)途徑介導(dǎo)閏細(xì)胞和主細(xì)胞之間轉(zhuǎn)變(IC-to-PC)。
在小鼠模型和人類腎臟疾病中,存在這種閏細(xì)胞向主細(xì)胞的轉(zhuǎn)變,并與代謝性酸中毒有關(guān)。
參考文獻(xiàn):Jihwan Park, Rojesh Shrestha, Chengxiang Qiu, et al. Single-cell transcriptomics of the mouse kidney reveals potential cellular targets of kidney disease. SCIENCE. April 05, 2018.