近日,百邁客云3.0正式上線,繼續(xù)加速國內(nèi)生命科學研究模式新變革。
變革:從線下到線上的基因組學數(shù)據(jù)分析模式變革
基因組學研究為21世紀生命科學研究領域中非常重要關鍵的一部分,而隨著近年來高通量測序技術的快速發(fā)展,基因數(shù)據(jù)呈現(xiàn)出指數(shù)增長,以高通量測序數(shù)據(jù)庫 SRA(NCBI維護)為例,2009年數(shù)據(jù)收錄量為10TB,2011年接近100TB,2014年突破了1PB,2015年接近5PB,2016年有 望突破10PB。依賴于本地服務器與專業(yè)生信分析人員的傳統(tǒng)數(shù)據(jù)分析模式已經(jīng)難以滿足這一大數(shù)據(jù)背景下的基因組學研究。面對基因數(shù)據(jù)的指數(shù)積累,傳統(tǒng)解決 方案是添置更多的本地服務器,招募更多的生物信息分析人員,而服務器配置維護、人員招募成本高昂,且可操作性低;其中部分生物學實驗室會選擇依賴于第三方 測序數(shù)據(jù)分析服務提供商。依賴于第三方數(shù)據(jù)分析服務存在分析周期長、溝通成本高、標準化的分析無法滿足科研需求等缺點,這些已經(jīng)嚴重制約了基因組學的順利 開展。
百邁客云整合新型的云計算技術與6年的生物信息分析經(jīng)驗為國內(nèi)的基因組學研究者提供了合理高效的解決新型方案。
云計算的獨到之處就在于幾乎可以提供無限廉價的存儲與計算能力。借助云計算技術,基因組學研究者可以通過網(wǎng)絡方便的獲取大量基因數(shù)據(jù)分析所需要的基礎計算 資源(存儲、計算等),無需購置昂貴的本地服務器。百邁客云借助這一技術輕松滿足了大數(shù)據(jù)背景下基因組學研究人員對于基礎計算資源的巨大需求。
作為國內(nèi)將云計算與生物信息融合的先驅者,百邁客云采用獨創(chuàng)的云計算文件系統(tǒng)BMKFS,該文件系統(tǒng)由百邁客研發(fā)人員針對生物信息分析的特點開發(fā),支持本 地的塊存儲和基于云的對象存儲(例如AWS的S3和阿里云的OSS)。使得用戶可以像使用本地硬盤一樣使用存儲,同時還提供了無限量存儲空間的擴展能力, 大大提高數(shù)據(jù)可用性。此外,文件系統(tǒng)還提供了多用戶資源隔離的機制,具備多種鑒權和授權機制,確保用戶的數(shù)據(jù)安全。該文件系統(tǒng)與現(xiàn)有的S3FS,S3QL 相比,讀寫性能都有了極大提升。另外,數(shù)據(jù)安全作為數(shù)據(jù)分析過程中重中之重,百邁客云平臺采用底層數(shù)據(jù)加密存儲,提供了嚴格的用戶資源隔離,并利用完善的 角色權限控制對用戶數(shù)據(jù)進行多級數(shù)據(jù)權限控制,網(wǎng)站的數(shù)據(jù)傳輸采用SSL加密傳輸協(xié)議,從多個層面確保用戶敏感的基因數(shù)據(jù)的安全。
作為專門為國內(nèi)基因組學研究者打造的生物信息分析云平臺,針對國內(nèi)生物信息分析人員相對稀缺、對第三方數(shù)據(jù)分析服務提供商依賴性較大的特點,百邁客云提供 了相較于國內(nèi)外同類型云計算平臺更高集成化程度的基因組學數(shù)據(jù)挖掘平臺,無需用戶自己整合各類分析軟件搭建分析流程,真正意義上實現(xiàn)一鍵完成數(shù)據(jù)分析,另 外分析平臺還提供了獨創(chuàng)性的個性化分析數(shù)據(jù)挖掘功能,分析內(nèi)容更加全面,無需依賴第三方,得到更加符合預期研究目的的數(shù)據(jù)分析結果,目前分析平臺覆蓋了轉 錄調控、微生物多樣性、動植物重測序、人類疾病等多個組學研究領域。另外,百邁客云也為用戶提供了更加快速、準確的公共數(shù)據(jù)檢索與分析功能,讓你的分析更 加有章可循,有據(jù)可參。
百邁客云是一個集大數(shù)據(jù)挖掘、共享、管理和科研協(xié)作的整合平臺,優(yōu)質的基礎資源通過網(wǎng)絡隨時獲取,可視化的操作界面適合無任何編程基礎以及生物信息分析經(jīng)驗的研究者,我們要做的就是讓你只需專注于科研,無需考慮IT。
百邁客云的出現(xiàn)是對生命科學研究模式的變革!
引領:從百邁客云測試版到百邁客云3.0,從早期測試到功能日趨完美
百邁客云于2014年5月開始上線測試,2015年9月召開產(chǎn)品論證會,到會專家有華中農(nóng)業(yè)大學信息學院院長張紅雨教授,中國科學院北京基因組研究所章張 研究員,阿里云批量計算服務、高性能計算產(chǎn)品經(jīng)理、高級專家叢蘭蘭女士,微軟資深合作伙伴、技術顧問、云計算家楊永波先生,論證會上專家們就云平臺的前期 開發(fā)給予了充分的肯定。2015年10月百邁客商業(yè)版百邁客云1.0云正式上線運營,成為了國內(nèi)較早適用于多個組學研究領域的綜合性的商業(yè)化運營生物云計算平臺。
目前百邁客云已經(jīng)積累的數(shù)以千計的注冊用戶,已經(jīng)為國內(nèi)基因組學研究人員成功解決了數(shù)百項的數(shù)據(jù)分析難題。平臺開發(fā)人員由引進于VMware、微軟的資深 云計算工程師與已處理過上萬個項目、發(fā)表數(shù)百篇SCI核心期刊文章的生物信息分析團隊組成,采用敏捷軟件開發(fā)模式,實現(xiàn)了系統(tǒng)的快速升級與功能的快速優(yōu) 化,從測試版本上線到近日的百邁客云3.0上線,平臺已經(jīng)完成了數(shù)十次的整體升級與數(shù)百項的功能優(yōu)化。
百邁客云3.0的上線旨在為用戶提供全面的分析內(nèi)容、友好的用戶界面、流暢的分析體驗、簡單智能的分析操作,期待您的體驗與使用。
未來展望
百邁客云以基因數(shù)據(jù)的在線分析出發(fā),讓更多的用戶通過百邁客云平臺將數(shù)據(jù)分析變的簡單、經(jīng)濟,為生命科學研究提供強有力的支持。未來百邁客云希望用戶在使 用云平臺時既可以實現(xiàn)對數(shù)據(jù)的分析、共享,具有相同領域的用戶可以進行交流協(xié)作,也可以針對具體數(shù)據(jù)的處理進行分析工具的開發(fā),實現(xiàn)整個研究體系的互動和 和諧發(fā)展。