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答:基于lncRNA與其靶基因的作用方式,我們采用2種預(yù)測方法進行l(wèi)ncRNA的順式靶基因和反式靶基因進行預(yù)測:
第一種,lncRNA調(diào)控其鄰近基因的表達,主要根據(jù)lncRNA與gene的位置關(guān)系預(yù)測,lncRNA 100kb范圍內(nèi)的鄰近基因為其順式靶基因;
第二種,當(dāng)樣本數(shù)目比較多時,通過樣本間 lncRNA 與 mRNA 的表達量相關(guān)性分析方法來預(yù)測 lncRNA的反式靶基因。

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