主成分分析(Principal Component Analysis,PCA)是一種分析和簡化數(shù)據(jù)集的技術(shù),通過將方差進行分解,將多組數(shù)據(jù)的差異反映在二維坐標(biāo)圖上;主坐標(biāo)分析法(Principal coordinates analysis,PCoA)是一種與 PCA 類似的降維排序方法。PCoA與PCA的區(qū)別在于PCA是基于原始的物種組成矩陣所做的分析,使用的是歐式距離,僅僅比較的是物種豐度的不同,而PCoA首先根據(jù)不同的距離算法計算樣品之間的距離,然后對距離矩陣進行處理,使圖中點間的距離正好等于原來的差異數(shù)據(jù),實現(xiàn)定性數(shù)據(jù)的定量轉(zhuǎn)換。
最近文章