Q2. 如何進(jìn)行動植物的miRNA的靶基因預(yù)測？

答：植物miRNA可與mRNA的編碼區(qū)完全互補(bǔ)配對，并通過誘導(dǎo)mRNA降解而發(fā)揮抑制表達(dá)的作用。動物miRNA則可與mRNA的3’UTR區(qū)部分互補(bǔ)配對結(jié)合，進(jìn)而抑制翻譯的進(jìn)行，一般的，miRNA與mRNA的配對區(qū)域位于miRNA的5’端的 2-8個堿基，稱為種子區(qū)，只要種子區(qū)能與mRNA互補(bǔ)配對即可發(fā)揮作用，這也是一個miNRA能夠調(diào)控數(shù)百條mRNA的原因。
我們根據(jù)已知miRNA和新預(yù)測的miRNA與對應(yīng)物種的基因序列信息，植物用 TargetFinder軟件進(jìn)行靶基因預(yù)測；動物用miRanda和targetscan進(jìn)行靶基因預(yù)測。