轉(zhuǎn)錄組結(jié)果與基因組比對后，沒有相應(yīng)的注釋結(jié)果，我們認(rèn)為是New genes。但是,在NCBI注釋后，有些基因的注釋結(jié)果顯示是參考基因組物種，這種基因還能算是new genes嗎？

答：我們分析流程中是將測序的Reads比對到參考基因組，然后進(jìn)行拼接，其中一些reads比對到基因間區(qū)并且能拼接出完整的開放閱讀框，拼接出來的位于基因間區(qū)的這些基因即為新基因。預(yù)測得到的新基因才會進(jìn)行功能注釋，所以注釋結(jié)果與新基因的判斷沒有關(guān)系。